El desarrollo de este curso comprende el estudio del reino Plantae desde el punto de vista sistemático incluyendo tanto a las plantas no vasculares como vasculares, destacando en cada uno de los grupos sus aspectos evolutivos, las relaciones de parentesco, características morfológicas principales, distribución geográfica y su importancia a nivel ecológico y económico.

Con el curso de Botánica II (Botánica Sistemática) se pretende dar al estudiante las bases fundamentales de la clasificación, la nomenclatura vegetal, el manejo de los métodos de las escuelas Sistemáticas y proporcionar las herramientas teóricas y prácticas para facilitar el reconocimiento de los grupos vegetales tanto vasculares como no vasculares, haciendo uso de los conocimientos de morfología vegetal obtenidos previamente.