El Ingeniero Agroforestal por su actividad tiene siempre una estrecha relación con las plantas, tanto para su estudio como para su productividad. Igualmente tiene relación con el suelo, un elemento indispensable para la vida, en el cual existen innumerables especies de microorganismos. Para optimizar la producción debe conocer muy bien cuáles son los componentes tanto de plantas, microorganismos y animales, las reacciones que sufren sus células y la relación que existe entre la estructura de los componentes celulares y su función. Por tanto, el estudio de la bioquímica le permite tener las herramientas necesarias para profundizar en un aspecto particular de un proceso biológico y le sirve de base para otras disciplinar como la fisiología vegetal, genética, biotecnología y ecología.