En el curso de Bioquímica II se estudia principalmente las transformaciones químicas de las biomoléculas en las células humanas. En la célula ocurren miles de reacciones químicas que no se producen aisladamente, sino que muchas de ellas se encuentran concatenadas unas con otras y forman secuencias organizadas funcionalmente que reciben el nombre de vías metabólicas; en el metabolismo se hace posible el cambio permanente de materia y energía entre el organismo y el medio, que caracteriza a los seres vivos. Esto garantiza que la transformación de determinados compuestos se canalice por vías específicas que respondan a las necesidades celulares. Todos los procesos normales y patológicos que ocurren en el ser vivo tienen un sustrato bioquímico. La tendencia actual en la investigación biomédica, es de explicar los cambios bioquímicos que ocurren en el organismo y que son responsables de las enfermedades.